物語は、主人公リンクが激しい嵐の中で海を漂う場面から始まります。
意識を失い波に飲まれたリンクは、見知らぬ浜辺に打ち上げられ、目を覚ますと不思議な島「コホリント島」にいることに気づきます。
この島には、他のどこにもない不思議な空気が漂い、謎めいた住人たちが暮らしていました。
島を探索する中でリンクは「風の魚」という巨大な存在が島の秘密に深く関わっていることを知ります。
風の魚はコホリント島のどこかで眠っており、彼を目覚めさせることが島からの脱出方法だと告げられます。
リンクは、風の魚を目覚めさせるために必要な「楽器」を集める冒険に出ることを決意します。
しかし、島の奥深くには、リンクの旅を阻む強力なモンスターや数多くの謎が待ち受けており、彼が集めるべき楽器にも不思議な力が秘められています。
冒険を進めるたびに、リンクはこの島に隠された「夢」のような真実と向き合わざるを得なくなり、やがて自らの選択が島の運命を左右することに気づくのです。
現実と幻想が交錯するコホリント島。
リンクが目指す真実の先には、彼の勇気を試す最後の試練が待っています。
この小さな島で繰り広げられる冒険は、ひとつの夢の物語として、静かにそして深くリンクの心に刻まれていくことでしょう。
トロンボ海岸で剣を入手する
【目的】
メーベの村でタリンと話して「盾」をもらい、トロンボ海岸で「剣」を拾う。
【Tips】
タリンからもらった「盾」を使えば敵の攻撃を防げます。剣を入手するまでは攻撃できないので、盾で守りながら進みましょう。途中のウニは盾で押して進むことができます。トロンボ海岸の浜辺に落ちている「剣」を拾い、攻撃が可能になります。剣のタメ攻撃（回転斬り）は攻撃ボタンを長押しすると発動します。
ふしぎの森でネボケタケを入手する
【目的】
ふしぎの森の洞窟で「ネボケタケ」を入手し、魔法おばばの家で「魔法の粉」を手に入れる。
【Tips】
森の道をふさいでいる草は剣で切ると進めます。森の東側にある洞窟に入り、内部を進んで外に出ましょう。ヒビが入った床は長く立ち止まると崩れるので注意。出口近くで「ネボケタケ」を拾い、魔法おばばの家へ向かいます。道中、ハートを回復できる「妖精の泉」があるので、必要なら立ち寄りましょう。魔法おばばの家では「ネボケタケ」と引き換えに「魔法の粉」がもらえます。
ふしぎの森でテールのカギを入手する
【目的】
ふしぎの森で「テールのカギ」を入手し、メーベの村に戻る。
【Tips】
いたずらタヌキに「魔法の粉」を使うと、道をふさいでいたタヌキが正体を現し、進めるようになります。奥にある宝箱から「テールのカギ」を入手しましょう。その後、メーベの村に戻って「テールのほらあな」を目指します。
テールのほらあなをクリアする
【目的】
「テールのカギ」を使ってテールのほらあなに入る。
【Tips】
テールのほらあなは、入り口前にある鍵穴付きの像を調べ、「テールのカギ」を使うことで入れるようになります。このダンジョンでは進行に必要なアイテムや謎解きがいくつかあり、出口に向かって進んでいきます。クリアすると次の目的地へ進むことができます。
タルタル高地でワンワンを助ける
【目的】
タルタル高地で「オヤブリン」を倒し、ワンワンを救出する。
【Tips】
タルタル高地にあるフクロウ像の横の洞窟に入り、中ボス「オヤブリン」を倒します。壁に突進させて気絶したところを攻撃してダメージを与えましょう。ワンワンを助けて洞窟を出たら、近くの石の下にワープポイントがあるので、開放しておくと便利です。
ゴポンガの沼を目指す
【目的】
ゴポンガの沼を通過し、ツボのどうくつを目指す。
【Tips】
沼の中には毒花が生えており、ワンワンが食べてくれることで道が開けます。ワンワンの力を借りて通路を進み、毒花に囲まれた「ツボのどうくつ」の入口へ向かいましょう。
ツボのどうくつをクリアする
【目的】
ツボのどうくつを攻略し、先へ進むためのアイテムを入手する。
【Tips】
ツボのどうくつではさまざまな謎解きが待っています。ダンジョン内のモンスターを倒したり、アイテムを活用しながら進めていきましょう。特定の敵や障害物は戦略的に配置されているので、周囲を確認しつつ慎重に進むとよいでしょう。クリア後は次の目的地に進むことができます。
メーベの村でワンワンを返す
【目的】
ゴポンガの沼から戻り、メーベの村でワンワンを返す。
【Tips】
村へ戻る途中で岩が邪魔な場所がありますが、パワーブレスレットを入手することで岩を持ち上げて進むことが可能です。道具屋でスコップやバクダンも入手しておくと、この先の攻略がスムーズになります。村に戻ったら、マダムニャンニャンの家でワンワンを返しましょう。
カナレットの城で黄金の葉っぱを入手する
【目的】
アナボコ畑でリチャードから依頼を受け、カナレットの城で黄金の葉っぱを集める。
【Tips】
リチャードの依頼で、カナレットの城にある5枚の「黄金の葉っぱ」を集めます。城の敷地内に入るには、サルキッキから「ぼうきれ」を入手して橋を作ってもらう必要があります。城内では、壁のヒビをバクダンで破壊して出現するタートナックや、モンスターを倒すことで入手できる黄金の葉っぱもあります。各エリアを順番に探索し、5枚の黄金の葉っぱを集めましょう。
アナボコ畑でスライムのカギを入手する
【目的】
リチャードに報告後、アナボコ畑の石像前で「スライムのカギ」を掘り出す。
【Tips】
リチャードの家の地下道を通ってアナボコ畑に進みます。畑は穴が多く、進む際は足元に注意が必要です。目的地である石像の前でスコップを使い、「スライムのカギ」を掘り出しましょう。
カギの穴ぐらをクリアする
【目的】
スライムのカギを使い、カギの穴ぐらに入ってクリアする。
【Tips】
ウクク草原のカギの穴ぐら入口でスライムのカギを使うと、ダンジョンへの道が開きます。内部のギミックを解きながら進めば、この先の目的地に進めるようになります。
ヤーナ砂漠でアングラーのカギを入手する
【目的】
ヤーナ砂漠で中ボス「ラネモーラ」を倒し、「アングラーのカギ」を手に入れる。
【Tips】
ヤーナ砂漠の奥にある流砂エリアに入ると中ボス「ラネモーラ」が現れます。流砂に落ちるとこれまでのダメージがリセットされるため、足元に気をつけながら戦いましょう。ラネモーラを倒すとカギが現れるので、拾って次の目的地へ向かいます。
タルタル高地でアングラーの滝ツボをクリアする
【目的】
タルタル高地でアングラーの滝ツボの入口を開き、ダンジョンをクリアする。
【Tips】
滝の前でアングラーのカギを使用すると、アングラーの滝ツボが姿を現し、入れるようになります。タルタル高地側から滝ツボに入るためには、タルタル山脈内の洞窟を通り抜けて進む必要があります。タルタル山脈内は短い一本道が多いので、道順通りに進みましょう。
おばけの願いを叶える
【目的】
どうぶつ村でおばけのイベントを進め、おばけをお墓に連れて行く。
【Tips】
どうぶつ村でクリスティーヌから「手紙」をもらい、わらしべイベントを進めながら、おばけをお墓に連れて行きます。おばけから「妖精のビン」をもらえるので、後の戦闘に備えて妖精を保存しておくと便利です。必要ならば、メーベの村で「かぜのさかな」のメロディも確認しておきましょう。
ナマズの大口をクリアする
【目的】
ナマズの大口に入り、ダンジョンをクリアする。
【Tips】
ナマズの大口は、周囲が岩に囲まれていますが、横から海に潜ることで入れます。ダンジョン内にはいくつかの謎解きや敵が配置されていますが、攻略しながら進みましょう。このダンジョンをクリアすると次のステージへ進めるようになります。
南の神殿でフェイスのカギを入手する
【目的】
南の神殿で中ボス「デグアモス」を倒し、「フェイスのカギ」を手に入れる。
【Tips】
マーサの入り江の人魚像に「人魚のウロコ」をはめると地下への階段が現れ、そこで「みとおしレンズ」を入手できます。南の神殿の奥に進むと中ボス「デグアモス」が現れます。ロック鳥の羽根で攻撃を避けながら剣で攻撃して倒しましょう。倒すと「フェイスのカギ」が手に入るので、それを使って顔の神殿を目指します。
顔の神殿をクリアする
【目的】
顔の神殿に入り、ダンジョンをクリアする。
【Tips】
フェイスのカギを使用して、顔の神殿の入口を開きましょう。神殿内の敵やトラップを避けつつ進み、必要なアイテムや仕掛けをクリアしていくことで、ダンジョンを攻略できます。この神殿をクリアすると、次のチャートへ進むことが可能です。
メーベの村で空飛ぶニワトリを連れてくる
【目的】
看板の迷路で「カエルのソウル」を覚え、メーベの村で空飛ぶニワトリを仲間にする。
【Tips】
ウクク草原のワープポイントから少し南にある「看板の迷路」へ進みましょう。看板の指示通りに進むと地下への階段が現れ、マムーから300ルピーで「カエルのソウル」を教わることができます。その後、メーベの村へ戻り、風見鶏を押して地下に降りてニワトリの骨の前で「カエルのソウル」を吹くと、空飛ぶニワトリが仲間になります。弓矢もこのタイミングで購入しておくと便利です。
タルタル山脈でバードのカギを入手する
【目的】
空飛ぶニワトリを使い、タルタル山脈の洞窟内で「バードのカギ」を入手する。
【Tips】
タルタル山脈のニワトリ小屋近くの洞窟に入り、空飛ぶニワトリで崖を飛び越えて「バードのカギ」を取得します。これでオオワシの塔への入口が開けられるようになります。
オオワシの塔をクリアする
【目的】
オオワシの塔に入り、ダンジョンをクリアする。
【Tips】
バードのカギを使用してオオワシの塔の入口を開き、内部へ進みます。オオワシの塔では、かがみの盾を手に入れることができるので、必ず入手しておきましょう。塔の攻略後、次のダンジョン（カメイワ）への準備が整います。
タルタル山脈でカメイワを復活させる
【目的】
カメイワを目覚めさせてダンジョンに入れるようにする。
【Tips】
タルタル山脈の西側で進行中にマリンが危険な目に遭うので、フックショットを使って助けてあげましょう。その後、カメイワの前で「カエルのソウル」を吹くと、中ボス「カメイワ」が出現します。壁にぶつかったタイミングでバクダンを使用してダメージを与え、顔の岩が割れた後は剣で攻撃します。倒すとカメイワ内に入ることが可能となります。
カメイワをクリアする
【目的】
カメイワのダンジョンを攻略する。
【Tips】
カメイワを進むには「弓矢」が必要になる場面があるので、準備がまだの場合はメーベの村で購入してから挑みましょう。カメイワの中にはいくつかの強敵やトラップがありますが、順序よく謎解きを進め、ダンジョンを攻略していきます。
村の図書館でヒミツの本を読む
【目的】
村の図書館で「ヒミツの本」を読み、聖なるタマゴの道順を確認する。
【Tips】
メーベの村に戻り、図書館の右下にある色の違う本を調べると、聖なるタマゴの進行ルートが書かれています。この本を読むためには、わらしべイベントで「みとおしレンズ」を入手している必要があるため、まだの場合は事前に用意しておきましょう。
かぜのさかなを目覚めさせる
【目的】
タマランチ山で「かぜのさかな」を目覚めさせるために聖なるタマゴへ入る。
【Tips】
タマランチ山に到着し、聖なるタマゴの前で「かぜのさかな」を吹くと、タマゴへの入口が開きます。セイレーンの楽器を8つ揃えた状態で吹く必要があるので、すべての楽器を揃えてから挑みましょう。
ラスボス「シャドー」を倒す
【目的】
タマゴ内部でラスボス「シャドー」と対決し、エンディングを迎える。
【Tips】
聖なるタマゴ内ではヒミツの本の通りに進むことで、ラスボス「シャドー」のいる場所にたどり着きます。シャドーは形態が変化し、その都度攻撃方法も異なるため、状況に応じた攻撃手段で対処しましょう。シャドーを倒すことでエンディングとなります。
エンディング
リンクが訪れた「コホリント島」は、
「かぜのさかな」が見ている夢の世界だった。
リンクは「かぜのさかな」を目覚めさせるため、
夢の世界に巣食う悪夢「シャドー」と戦い、これに勝利する……。
シャドー「消えてしまう……壊れてしまうわれらの島が われらの世界が……」
砕け散るシャドー。
そして、どこからともなく声が聞こえてくる。
「リンクよ、よくぞ悪夢に打ち勝った！あがってきなさい。」
リンクは出現した階段を上り、頂上にたどり着く。
そこにはフクロウが待っていた。
フクロウ「ホッホウ！リンクどの、よくぞ悪夢に打ち勝った！その知恵、力、勇気は、まこと勇者の証じゃ！わしは【かぜのさかな】の心のひとつなのじゃ。
【かぜのさかな】が眠るあいだ、ユメの世界を守ることがわしの役目じゃった。
ありがとうリンクどの……これで、わしの役目は終わった。」
フクロウの姿がかき消え、代わりに大きなクジラのような生き物が姿を現す。
かぜのさかな「……わたしは、かぜのさかな……
……はじめ、わたしはタマゴのユメをみていた……
やがて、タマゴのまわりに島ができ、
人や動物が生まれ、世界が生まれた……
しかし、ユメは覚めるもの。それが、自然のさだめなのだ。
わたしが目覚めると、コホリント島は消えるだろう。
しかし、この島の思い出は心に残る。
そして……キミはいつかこの島を思い出すだろう。
ありがとうリンク……時は満ちた！共に目覚めよう！！」
リンクは楽器を取り出し、【かぜのさかなの歌】を演奏する。
かぜのさかなの目覚めと共に、夢の世界が消えてゆく。
村が消え、村人たちが消え、そしてマリンもまた、大好きな歌を歌いながら消えていく。
コホリント島は姿を消し、すべては静寂に包まれる。
・・・気がつくと、リンクは小さな木片につかまり大海原を漂っていた。
周囲には、コホリント島の影も形もない。
ぼんやりと海を眺めるリンク。
すると、太陽の光が何かにさえぎられる。
リンクが空を見上げると、
そこには空を泳ぎ、どこかへと去っていく「かぜのさかな」の姿があった。
そして、一匹の『カモメ』が、広がる空を自由に飛んでいく・・・
THE END